Resumo: O objetivo deste trabalho foi estimar os efeitos da interação genótipo x ambiente e o potencial genotípico de cultivares de arroz irrigado por inundação, lançadas entre 1972 e 2017, para o Rio Grande do Sul. Os experimentos foram realizados em campo, em todas as regiões agroclimáticas de cultivo de arroz irrigado por inundação do estado, entre os anos agrícolas de 2005/2006 e 2015/2016, no total de 60 ambientes, com 1.961 unidades experimentais. Vinte e cinco cultivares de arroz irrigado foram avaliadas quanto aos caracteres produtividade de grãos, altura de plantas, dias para o florescimento e qualidade de grãos inteiros após o beneficiamento. Os valores de adaptabilidade e estabilidade foram estimados por meio de modelos mistos. As cultivares de arroz BRS Pampa, BRS Pampeira e BRSCIRAD 302 apresentaram, simultaneamente, alta produtividade genotípica de grãos, adaptabilidade, estabilidade, bons atributos agronômicos e bom rendimento de grãos inteiros após o beneficiamento. 'BRSCIRAD 302' e 'BRS Pampa' apresentam alta estabilidade produtiva e podem ser recomendadas para cultivo em todas as regiões orizícolas do Rio Grande do Sul. 'BRS Pampeira' é responsiva às melhorias do ambiente e é indicada para condições de alta tecnologia.

Abstract: The objective of this work was to estimate the effects of genotype x environment interaction and the genetic potential of flood-irrigated rice cultivars, released between 1972 and 2017, for the state of Rio Grande do Sul, Brazil. The experiments were carried out in the field, in all agroclimatic regions of flood-irrigated rice crop in the state, between the 2005/2006 and 2015/2016 crop years, totaling 60 environments (trials), with 1,961 experimental units. Twenty-five cultivars of irrigated rice were evaluated for the traits grain yield, plant height, days to flowering, and whole grain quality after milling. The values of adaptability and stability were estimated with the aid of mixed models. The rice cultivars BRS Pampa, BRS Pampeira, and BRSCIRAD 302 showed simultaneously high-genotypic grain yield, adaptability, stability, good agronomic traits, and good whole-grain yield after milling. 'BRSCIRAD 302' and 'BRS Pampa' show high-yield stability and can be recommended for all rice cultivation regions of Rio Grande do Sul. 'BRS Pampeira' is responsive to environmental improvements and is indicated for high-technology conditions.

ABSTRACT: Mycotoxin levels in Fusarium head blight (FHB) infections can be difficult to quantify. The relationship between mycotoxin and disease is not consistent and it is not clear if wheatpathogen interaction is of significance in regions where more than one Fusarium species with distinct trichothecene production ability co-exists. This study aimed to investigate whether a set of eight Brazilian wheat genotypes, varying in resistance according to classification by the breeder, exhibit a common or differential resistance to Fusarium graminearum (Fgra) (deoxynivalenolproducing) and Fusarium meridionale (nivalenol-producing) (Fmer) using full-spike and central spikelet inoculation (type II resistance). Fgra was generally more aggressive than Fmer based on the percentage of diseased spikes (99 and 84 %, respectively) and number of diseased spikelets (mean 2.8 and 2.0, respectively) below the central spikelet. The genotype-pathogen species interaction was not significant, but there were differences between the genotypes, with BRS 194 and BRS 327 being the least and most resistant, respectively, based on severity ratings. The incidence of Fusarium-damaged kernel (FDK, %) was not affected by species, but two genotypes (BRS Parrudo and BRS 327) showed a lower incidence of FDK. There were substantial variations in the accumulation of deoxynivalenol and nivalenol among the genotypes, reaching maxima of 691.2 µg g−1 and 355.2 µg g−1, respectively, suggesting that Fgra is a more potent producer of trichothecene. Our data confirm prior resistance classifications by the breeders and suggest that the use of a single highly aggressive Fgra isolate may be sufficient for effective screening for FHB resistance. However, further studies are needed to elucidate the accumulation of resistance to trichothecene.

Resumo: O objetivo deste trabalho foi determinar o progresso genético de atributos de qualidade de grãos de cultivares de arroz (Oryza sativa) irrigado por inundação no Rio Grande do Sul, entre 1972 e 2016. As estimativas genéticas seguiram a abordagem baseada na análise comparativa das 25 cultivares lançadas pelo programa de melhoramento genético da Embrapa ao longo desse período. O experimento foi implementado em quatro regiões produtoras do Estado do Rio Grande do Sul: Sul, Campanha, Planície Costeira Interna e Planície Costeira Externa. Observaram-se ganhos genéticos significativos de: 0,20% ao ano, para percentual de grãos inteiros após o beneficiamento; -1,38% ao ano, para percentual de grãos gessados e centro branco; -0,77% ao ano, para área gessada total; -0,08% ao ano, para brancura total; e -0,82% ao ano, para brancura não vítrea dos grãos. A maioria das cultivares lançada apresenta alto teor de amilose e baixa temperatura de gelatinização. Portanto, o programa de melhoramento genético apresentou progressos genéticos anuais significativos entre 1972 e 2016 para os principais atributos de qualidade dos grãos, tendo disponibilizado cultivares de acordo com a demanda nacional quanto à qualidade dos grãos nos diversos segmentos da cadeia produtiva do arroz.

Abstract: The objective of this work was to determine the genetic progress of grain quality attributes of flooded irrigated rice (Oryza sativa) cultivars in the state of Rio Grande do Sul, Brazil, between 1972 and 2016. The genetic estimates followed an approach based on the comparative analysis of 25 cultivars released by Embrapa’s breeding program over this period. The experiment was implemented in four producing regions of the state of Rio Grande do Sul: Sul, Campanha, Planície Costeira Interna, and Planície Costeira Externa. The following significant genetic gains were observed: 0.20% per year, for percentage of whole grains after processing; -1.38% per year, for percentage of chalky kernels and white-core grains; -0.77% per year, for total chalky area; -0.08% per year, for total whiteness; and -0.82% per year, for non-vitreous grain whiteness. Most cultivars released have high amylose content and a low gelatinization temperature. Therefore, the breeding program presented significant annual genetic progresses between 1972 and 2016 for the main attributes of grain quality, and made cultivars available according to the national demand for grain quality in the several segments of the rice production industry.

RESUMO Considerando-se a necessidade de incremento de variabilidade genética dentro dos programas de melhoramento de arroz irrigado no Brasil, este trabalho objetivou caracterizar fenotipicamente acessos de arroz irrigado e estimar as suas distâncias genéticas com a utilização de análises multivariadas. Foram caracterizados fenotipicamente 92 acessos de arroz irrigado avaliados quanto a 35 descritores morfológicos, sendo, 21 caracteres de herança qualitativa e 14 caracteres de herança quantitativa. Os caracteres quantitativos discriminaram via distâncias genéticas os acessos em nove grupos distinguíveis entre si, principalmente pela distribuição das subespécies indica e japonica. Já para os caracteres qualitativos o dendrograma discriminou cinco grupos distintos, sendo evidenciadas a seleção e utilização de genótipos a nível mundial com arquitetura e padrões fenotípicos definidos. Logo, evidenciou-se pela caracterização fenotípica via análise multivariada que os genótipos cultivados no Rio Grande do Sul demonstraram estreita base genética. No entanto, existe variabilidade fenotípica para incremento desta base genética e consequente aumento da probabilidade de obtenção e seleção de progênies superiores geneticamente.

ABSTRACT Considering the need for increasing genetic variability in breeding programs of irrigated rice in Brazil, the aim of this work was to characterise phenotypically accessions of irrigated rice, and estimate genetic distance using multivariate analysis. Ninety-two accessions of irrigated rice were characterised phenotypically, and evaluated for 35 morphological descriptors, with 21 being characteristics of qualitative inheritance, and 14 quantitative inheritance. The quantitative characteristics discriminated the accessions into nine groups via genetic distance, distinguished from each other mainly by distribution of the subspecies indica and japonica. Whereas for the qualitative characteristics, five different groups were discriminated by dendrogram, demonstrating the global selection and use of genotypes with defined architecture and phenotypic patterns. From the phenotypic characterisation via multivariate analysis, it soon became clear that the genotypes grown in the State of Rio Grande do Sul displayed a narrow genetic base. However, the phenotypic variability exists for increasing this genetic base, with a consequent increase in the probability of acquiring and selecting genetically superior progeny.

RESUMO: O caráter stay-green tem sido relacionado à maior tolerância a estresses e a produtividade pela manutenção mais prolongada do aparato fotossintético. A relação deste caráter com a produtividade de grãos talvez esteja associada a uma rede de características que não somente a massa de grãos. O objetivo do estudo é trazer à luz a real contribuição do caráter stay-green em trigos brasileiros, na relação entre os caracteres definidores da produtividade de grãos, em diferentes condições de ambiente. O experimento foi conduzido em delineamento experimental de blocos casualizados com três repetições, nos anos de 2003, 2004 e 2005. Foram avaliadas linhagens-irmãs com presença e ausência do caráter stay-green, analisando a correlação fenotípica e trilha separadamente por ano e grupo de maturação. Em condições favoráveis de cultivo, a contribuição do caráter stay-green em trigo se dá pelo aumento da fertilidade de espiga, incrementando o número de grãos. Num cenário mais restritivo, favorece a massa de grãos pelo maior tempo de enchimento no final do ciclo.

ABSTRACT: The stay-green character has been related to greater stress tolerance and yield through longer activity of the photosynthetic apparatus. Association of this character with grain yield may be linked to a network of features other than the grain mass. This study aimed to shed light on the actual contribution of stay-green character in Brazilian wheats and the associations between grain yield components in different environmental conditions. The experiment was conducted in a randomized block design with three replications in the years 2003, 2004 and 2005. Sibling lines with and without the stay-green character were evaluated analyzing the phenotypic correlation and path analysis separately by year and maturity group. Under favorable growing conditions, the contribution of stay-green character in wheat is obtained by the increased ear fertility and number of grains. In a more restrictive scenario, it favors an increase in grain mass by longer filling time at the end of the cycle.

Adjustment of seeding schemes is one of the crop management techniques that most influences grain yield components. This work aimed to characterize the potential grain yield and its components in wheat (Triticum aestivum L.) genotypes with contrasting tillering ability under different seeding densities and environments. Five experiments were conducted in split-plot design, each with ten cultivars (main plot), sown in five distinct seeding densities (subplots). Experiments were sown in three locations in southern Brazil in the years 2005, 2006 and 2007. The grain yield per plot and its yield components: number of fertile tillers, weight of 1,000 grains, ear weight and number of grains per ear were evaluated. Genotypes with reduced tillering ability expressed an increase in grain yield with an increase in seeding densities, however showing a reduction in ear weight. The number of grains per ear did not affect grain yield but was highly influenced by seeding densities. The compensatory effect was expressed by the weight of a thousand grains as a function of the experimental conditions in which the genotypes were evaluated, regardless of seeding densities used. Results pointed to differences among cultivars tested in specific locations and years.

O objetivo deste trabalho foi determinar o desempenho per se e os parâmetros genéticos de caracteres de interesse, em linhagens de trigo que expressam ou não o caráter "stay‑green". O experimento foi conduzido em 2003, 2004 e 2005, em delineamento experimental de blocos ao acaso, com três repetições. Foram avaliadas 32 linhagens irmãs de trigo, 15 com e 17 sem o caráter "stay‑green". As linhagens portadoras desse caráter apresentaram maior produtividade de grãos, maior número de grãos por espiga e menor massa de mil grãos. Além disso, as herdabilidades da produtividade e da massa de grãos foram maiores nessas linhagens, o que revelou menor influência de variações ambientais sobre a expressão desses caracteres. O caráter "stay‑green" contribui para o aumento da produtividade e da estabilidade produtiva do trigo.

The objective of this work was to determine the per se performance and the genetic parameters of traits of interest in wheat inbred lines expressing or not the "stay‑green" character. The experiment was carried out in 2003, 2004, and 2005 in a randomized complete block design with three replicates. Thirty‑two sister‑lines of wheat, 15 with and 17 without the stay‑green character, were evaluated. The lines carrying this character showed higher grain yield, higher average number of kernels per ear, and lower weight of a thousand grains. Moreover, grain yield and grain mass heritabilities were higher in these lines, which reveled lower influence of environmental variation on the expression of these characters. The "stay‑green" character contributes to increase productivity and productive stability of wheat.

The white oat cultivar FAEM Carlasul was developed at the Plant Genomics and Breeding Center, Faculty of Agronomy Eliseu Maciel, Federal University of Pelotas, as a result of the cross between UFRGS 10 and 90SAT-28 (Coronado2/Cortez3/Pendek/ME 1563). It is characterized by high yield and grain quality.

A cultivar de aveia branca Brisasul foi desenvolvida pelo Centro de Genômica e Fitomelhoramento da Faculdade de Agronomi 'Eliseu Maciel', Universidade Federal de Pelotas, sendo resultado do cruzamento entre OR 2 e UPF 18. Caracteriza-se pelo elevado rendimento de grãos, porte reduzido e elevada resistência ao acamamento.

The white oat cultivar Brisasul was developed from the cross OR 2 x UPF 18 at the Centro de Genômica e Fitomelhoramento, Faculdade de Agronomia `Eliseu Maciel', Universidade Federal de Pelotas. The most important traits are high yield, low stature and high lodging resistance.

O objetivo do trabalho foi determinar a capacidade combinatória de três genitores de aveia branca (UPF 18, URS21 e URS 22) e estimar a heterose dos híbridos F1 nas condições, com e sem estresse hídrico. Os resultados indicaram grande efeito do ambiente sobre os caracteres avaliados (ciclo, área foliar, estatura de planta, produção de grãos por planta, massa da panícula principal e número de grãos da panícula principal), sendo o ambiente sem estresse o mais eficiente para seleção de genótipos superiores. Com base nas capacidades geral e específica de combinação, a cultivar URS 22 mostrou-se apropriada para redução do ciclo e da estatura enquanto UPF 18 exibiu incrementos da área foliar, massa da panícula principal e número de grãos da panícula principal. O cruzamento específico entre URS 22 e URS 21 mostrou ser o mais promissor para seleção de genótipos superiores.

The goal of this work was to determine the combining ability of three white oat parental genotypes (UPF 18, URS21 and URS 22) and to estimate the heterosis of F1 hybrids in two conditions, with and without water stress. The results indicate a large effect of the environment on the evaluated characters (cycle, leaf area, plant stature, grain yield per plant, main panicle weight and number of grains of the main panicle). The condition without stress was the most efficient for the selection of superior genotypes. Based on the general and specific combining ability, the cultivar URS 22 was shown to be indicated for cycle and stature reduction, while UPF 18 lead to increases in leaf area, main panicle weight and number of grains of the main panicle. The specific cross URS 22 x URS 21 was the best for the selection of superior genotypes.

Os objetivos do trabalho foram determinar a adaptabilidade e estabilidade do rendimento de grãos de dez genótipos de trigo (Triticum aestivum L.), contrastantes para o caráter potencial de afilhamento, implantados em diferentes densidades de semeadura. Os experimentos foram realizados nas safras agrícolas de 2005, 2006 e 2007, no município de Capão do Leão (RS) e na safra de 2007 nos municípios de Pato Branco (PR) e Ijuí (RS) Utilizou-se o delineamento de parcelas divididas, com a parcela composta pelo fator cultivar, e as subparcelas pelas densidades de semeadura, com 50, 200, 350, 500 e 650 sementes aptas por metro quadrado. O estudo da adaptabilidade e estabilidade foi realizado por meio do método de Eberhart e Russell. A modificação da densidade de semeadura e o favorecimento do ambiente de cultivo afetaram intensamente os parâmetros de adaptabilidade e estabilidade do caráter rendimento de grãos. Foram constatados genótipos adaptados a todas as densidades de semeadura (FUNDACEP 29 - exceto para 650 sementes m-2), ou com adaptabilidade especifica e comportamento previsível apenas em ambientes favoráveis (CD 114) e ambientes desfavoráveis (CD 108), indicando a necessidade de um ajuste adequado da densidade de semeadura para a resposta e previsibilidade de comportamento quanto ao rendimento de grãos em trigo.

The objectives of this work were to determine the grain yield adaptability and stability of ten wheat genotypes (Triticum aestivum L.), contrasting for the character tillering potential, conducted in different seeding densities. The experiments were conducted in the years 2005, 2006 and 2007 in Capão do Leão -RS and in Pato Branco-PR and Ijuí-RS in the year 2007. A split-plot design was used considering the genotype as the plot and seeding density as the sub-plot. The seeding densities used were 50, 200, 350, 500 and 650 viable seeds m-2. The analyses of adaptability and stability were performed using the method proposed by Eberhart and Russell. The changes in seeding density and location intensely influenced the adaptability and stability parameters for grain yield. Genotypes adapted to various seeding densities were found (FUNDACEP 29 - except for 650 seeds m-2), as well as those with specific adaptability and a predictable performance only in favorable (CD 114) and unfavorable (CD 108) environments, indicating the need of an adequate fitting of seeding density to the performance predictability for grain yield in wheat.

Foram estudados o crescimento, a partição de assimilados e a produção de grãos nas cultivares de arroz BRS Pelota (maior produtividade) e BRS Firmeza (menor produtividade). O experimento foi realizado em casa de vegetação, com plantas cultivadas em vaso. Utilizou-se o delineamento experimental inteiramente casualizado, com duas cultivares, nove coletas e quatro repetições por tratamento. Com a cultivar BRS Pelota houve maior acúmulo de matéria seca total (Wt), principalmente no fim do ciclo, bem como maior área foliar (Af). A matéria seca alocada para o colmo + bainha e às panículas também foi maior em BRS Pelota. Porém, a porcentagem de Wt destinada às panículas aos 125 DAE foi semelhante entre as cultivares. Em BRS Firmeza, o aumento em Wt nas raízes pode ter influenciado o direcionamento de fotoassimilados para os grãos e contribuído para o atraso na senescência das plantas. A produtividade de BRS Pelota foi maior que a de BRS Firmeza (17,4 contra 11,8 g por vaso) e seu número de panículas por planta por vaso foi três vezes superior em relação à cultivar BRS Firmeza. O componente de produção de maior expressão no rendimento foi o número de panículas. A maior produtividade da cultivar BRS Pelota pode estar relacionada à maior área foliar e sua duração, o que permite o fornecimento de elevada quantidade de fotoassimilados por um período maior.

The growth, assimilate partitioning and grain yield in BRS Pelota (high yield) and BRS Firmeza (low yield) rice cultivars were evaluated. The experiment was conducted in greenhouse (Department of Botany, Federal University of Pelotas) with complete randomized design composed by two cultivars, nine plant sampling times and four replicates. BRS Pelota rice cultivar exhibited higher accumulation of total dry matter (Wt), mainly at the end of life cicle, as well as higher leaf area (Af). The dry matter allocated toward culm + sheath and panicles was higher in BRS Pelota. However, the Wt percentage accumulated in panicles at 125 DAE was the same between cultivars. In BRS Firmeza the increase in Wt in the roots may had influenced photoassimilates partitioning toward grains, and also contributed to delay of in plant senescence. Grain yield was higher in BRS Pelota than in BRS Firmeza (17.4 versus 11.8 g vaso), and also panicle number was three times greater in relation to BRS Firmeza. The yield component which exhibited higher relevance for productivity was the panicle number. The higher grain yield of BRS Pelota could be related to higher leaf area and leaf area duration, which allows the provision of elevated quantity of photoassimilates during longer period time.

O objetivo deste trabalho foi avaliar as mudanças fisiológicas que ocorrem em diferentes folhas durante o início e o final do estádio de enchimento de grãos em dois genótipos de arroz (Oryza sativa subsp. indica cultivar BRS Pelota e O. sativa subsp. japonica cultivar BRS Firmeza) que apresentam diferenças no potencial de produção de grãos. As plantas foram cultivadas em casa de vegetação. Os teores de pigmentos, a fluorescência da clorofila e a taxa de liberação de oxigênio foram determinados no estádio de enchimento de grão da primeira à quarta folha (do topo à base). O teor de pigmentos, a eficiência fotoquímica do fotossistema II e o transporte de elétrons decresceram significativamente de acordo com a posição das folhas na cultivar BRS Pelota. A cultivar BRS Firmeza apresentou maior teor de pigmentos e maior atividade do aparato fotossintético em comparação à 'BRS Pelota' durante o estádio de enchimento de grão.

The objective of this work was to evaluate the physiological changes that occur in different leaves during the early and late grain-filling stages of two rice genotypes (Oryza sativa subsp. indica , BRS Pelota cultivar, and O. sativa subsp. japonica , BRS Firmeza cultivar), which present differences in grain yield potential. The plants were cultivated in greenhouse. Pigment content, chlorophyll fluorescence, electron transport and oxygen evolution rate were determined in the grain-filling stage, from the first to the forth leaf (top to bottom). Pigment content, photochemical efficiency of photosystem II and electron transport decreased significantly according to the position of leaves in 'BRS Pelota'. The BRS Firmeza cultivar shows higher pigment content and higher activity of the photosynthetic apparatus in comparison to 'BRS Pelota' during the grain-filling stage.

O ajuste da densidade de semeadura é uma das técnicas culturais que mais influenciam o rendimento de grãos, bem como outros caracteres agronômicos. O objetivo do trabalho foi determinar o estande ideal de plantas em que se possa obter o máximo rendimento de grãos em genótipos que apresentem diferente capacidade de afilhamento e, estabelecer a relação das constituições genéticas utilizadas com o afilhamento e outros caracteres de interesse agronômico como massa de mil grãos. Dois experimentos foram conduzidos no município de Capão do Leão/RS, nos anos de 2005 e 2006. Foram testadas dez cultivares de trigo inicialmente classificadas como de reduzido e de elevado potencial de afilhamento, sendo conduzidos no delineamento de parcelas subdivididas. Os resultados apontaram a necessidade da recomendação de cultivares testadas em mais de um ano de cultivo, principalmente quando utilizados genótipos contrastantes para o caráter número de afilhos férteis. Com relação ao estande ideal de plantas, independente do ano, a densidade de semeadura dos genótipos com reduzido potencial de afilhamento, relacionada com o ponto máximo de rendimento de grãos, está entre 417 e 555 sementes m-2, proporcionando também maior massa de mil grãos. Por outro lado, o estande ideal dos genótipos com elevado afilhamento, está entre 221 a 422 sementes m-2. Além disso, genótipos com baixo potencial de afilhamento propiciam a melhor relação direta do número de afilhos férteis com o rendimento de grãos da cultura, com efeito inverso na massa de mil grãos.

Seeding density adjustments is one of the practices that most influence grain yield, as well as other agronomic traits. Therefore, the objective of this study was to determine the ideal plant stand to achieve the maximum grain yield in genotypes showing differential tillering ability. Also, to establish the associations between the genotypes used with tillering and other agronomically important traits as weight of a thousand grains. Two experiments were conducted in 2005 and 2006 in Capão do Leão, Rio Grande do Sul state, Brazil. Five low (JURITI, BR 18, CEP 29, BR 18 and CD 108) and five high (CD 114, SAFIRA, FIGUEIRA, BRS 177 and UMBU) tillering potential wheat cultivars were tested for two years on a split-plot design. The results indicate the need for recommending cultivars based on more than one year of cultivation, especially when dealing with contrasting genotypes for the trait fertile tillers. Regarding the ideal plant stand, seeding density of low tillering ability genotypes ranges from 417 to 555 seeds m-2, in order to obtain maximum yield and grain weight. On the other hand, for high tillering ability genotypes, the ideal stand ranges from 221 to 422 seeds m-². These results were year independent. Furthermore, low tillering ability genotypes showed a closer association of number of fertile tillers with grain yield. However, an inverse association was found between number of fertile tillers and weight of a thousand grains.

O sucesso na obtenção de altas produtividades de soja depende da utilização de sementes de qualidade. Muitos problemas que comprometem a qualidade fisiológica das sementes podem ser relacionados às características do tegumento. Inúmeros trabalhos afirmam que sementes de soja com tegumento semipermeável à água apresentam maior tolerância a patógenos e pragas, menor susceptibilidade aos danos mecânicos, às adversidades climáticas e à deterioração por umidade. A inclusão das características de tegumento semipermeável nas cultivares atuais pode minimizar problemas relacionados à qualidade de sementes. Neste contexto, aliar as técnicas da biologia molecular com a bioinformática é uma importante estratégia para identificação dos genes envolvidos com o tegumento e com a fisiologia de sementes. O objetivo desse trabalho foi descrever e avaliar uma estratégia de utilização de ferramentas da bioinformática, para a integração in silico de informações de experimentos in vitro de marcadores moleculares, contra dados armazenados em bancos de dados genômicos e prever pela descrição funcional se estes marcadores podem estar associados a diferentes características do tegumento da soja. Foram utilizados 24 conjuntos de primers microssatélites, avaliados anteriormente e que amplificaram fragmentos polimórficos entre os genótipos de soja CD-202 (tegumento amarelo, permeável e susceptível à deterioração) e uma linhagem TP (tegumento preto, semipermeável e resistente a deterioração). Os resultados desta análise indicam como promissor o uso destes marcadores para estudos relacionados ao tegumento e à qualidade de sementes de soja. A estratégia da mineração de marcadores moleculares a partir da integração in silico de sequências de marcadores moleculares ainda anônimos, bancos de dados genômicos e bancos contendo seqüências com descrições funcionais dos genes demonstra ser promissora, pois, possibilita prever as funções para estes genes e verificar a associação destes com rotas bioquímicas e metabólicas responsáveis pelas características que se deseja analisar em rotinas in vitro.

Success in obtaining high soybean productivities depends on the use of high. quality seed. Many problems that damage the seed physiological quality can be related to the seed coat traits. Several studies state the existence of soybean seeds with a semi-permeable coat, which are more resistant to water penetration and less susceptible to mechanical damage, climatic adversities and moisture deterioration. The inclusion of the traits for semi-permeable coat in modern cultivars could minimize problems related to seed quality. In this context, molecular biology techniques in association with bioinformatics are an important alternative to identify genes involved in soybean seed coat and physiological quality. The objective of this study was to describe and to evaluate a strategy using bioinformatics tools, to integrate in silico information with in vitro experiments of molecular markers against data available in genomic databases, and provide information as to whether these markers could be associated with different soybean seed coat traits. Twenty four microssatelite primer sets previously tested and which amplified polymorphic fragments between soybean genotypes CD-202 (yellow seed coat, permeable and susceptible to deterioration) and TP (black seed coat, semi-permeable and resistant to deterioration) were used. The results indicated as promising the use of these molecular markers for studies related to soybean seed coat and quality. The strategy of molecular markers mining from in silico integration of yet anonymous molecular marker sequences and database containing gene sequences with functional descriptions, seems to be promising, as it allowed to predict the functions of these genes and to verify their association with metabolic and biochemical pathways involved in characteristics which are interesting to in vitro analyzes.